Le Syndicat du personnel de la CEA a été établi conformément au Règlement et Statut du personnel des Nations Unies, tel qu’indiqué à l'article 8: «Le Secrétaire général établit et entretient une liaison et un dialogue continus avec le personnel afin de veiller à ce qu’il concoure effectivement au recensement, à l’examen et à la solution des questions qui intéressent le bien-être des fonctionnaires, y compris leurs conditions de travail, leurs conditions de vie en général et d’autres aspects de l’administration des ressources humaines.... Il est créé des organes représentatifs du personnel qui ont le droit de présenter de leur propre initiative des propositions au Secrétaire général » aux fins de bien-être du personnel.
Les fonctions des représentants du personnel sont officielles. Les représentants du personnel ont les mêmes droits, obligations et privilèges que les autres membres du personnel des Nations Unies conformément au Statut et Règlement du personnel et jouissent d'une protection contre tout traitement discriminatoire ou action en leur défaveur prise en fonction de leur qualité ou leurs activités de représentants du personnel. “Aucun fonctionnaire ne doit user de menaces ni exercer ou tenter d’exercer des représailles contre tout représentant du personnel exerçant ses fonctions.»
L’Assemblée générale est l'organe suprême de délibération et de prise de décision du Syndicat du personnel de la CEA.
L'organe de surveillance du Syndicat du personnel CEA est le Conseil, qui est composé de représentants des Divisions de la CEA et les Bureaux sous-régionaux.
Les activités du Syndicat sont coordonnées par le Comité exécutif, présidé par le Président du Syndicat, qui dirige les opérations quotidiennes du bureau et conduit les négociations avec l’Administration.